加熱式たばこも、紙巻きたばこ同様に有害な物質が含まれており、がん・心疾患・脳卒中・糖尿病などの様々な病気にかかる危険性が懸念されています。

発生する煙（エアロゾル）には、有害な成分が含まれていて、周囲の人が吸い込むことで受動喫煙による健康被害を引き起こす可能性があります。

加熱式、紙巻きたばこにかかわらず喫煙習慣があると、ニコチンによる強い依存性により生活習慣病のリスクを引き上げます。

加熱式たばこも原則、屋内での喫煙は禁止されています。紙巻きたばこ同様に喫煙室のみで喫煙することができます。